输卵管畸形是在发育过程中没有按照正常的发育，出现一些小障碍，导致了输卵管的畸形，这个在临床中还是很少见的，从输卵管畸形上一般从外面开始，输卵管畸形大部分是内生殖器器官，外生殖器官还有性发育异常引起的，比如说阴蒂增大，或者是会阴体特别高，还有女性虽然是有阴道，但是阴蒂很大，像小阴茎等等，临床医学不讨论类似情形，因为染色体的异常或激素的异常而导致的输卵管畸形是无法治疗的。

机械性输卵管畸形是有一些脱落的栓子及器官的功能性收缩所造成的。常见的栓子有月经期的内膜碎片、血凝块，药物流产及人工流产时由于子宫收缩及流产时的子宫付压吸引的突然解除，引起胚胎组织及胚胎附属物进入输卵管造成输卵管畸形。还有的是由于输卵管液的固缩引起输卵管畸形，计划生育中所进行的输卵管粘堵术等；输卵管受到一些刺激时会发生功能性痉挛致开口及管腔收缩而形成输卵管的畸形。不过在机械性输卵管畸形中这样的机会机会还是少见的，最常见的是在不孕症病因寻找时进行输卵管畸形检查时所引起，如输卵管通液检查，输卵管造影检查，腹腔镜下输卵管美兰通液等，由于医生技术操作粗暴，技术操作不成熟；或由于患者自身对痛疼过于敏感等所引起输卵管间质部痉挛造成的输卵管畸形发育。